Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRTM2O43300 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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