Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DYNC1LI2O43237 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms