Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBDO15205 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBDO15205 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBDO15205 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBDO15205 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBDO15205 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBDO15205 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBDO15205 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms