Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC1BO15143 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms