Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APAF1O14727 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APAF1O14727 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APAF1O14727 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APAF1O14727 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APAF1O14727 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APAF1O14727 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APAF1O14727 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
APAF1O14727 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APAF1O14727 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APAF1O14727 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APAF1O14727 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APAF1O14727 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APAF1O14727 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APAF1O14727 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms