Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRTO14522 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRTO14522 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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