Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F3O00716 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms