Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KPNA3O00505 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KPNA3O00505 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms