Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CDO00329 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms