Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIEO00221 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms