Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L21D6R901 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L21D6R901 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms