Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DIRC3C9JPN6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms