Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL2C9JE40 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms