Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-1B6SEH8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-1B6SEH8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms