Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF879B4DU55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF879B4DU55 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF879B4DU55 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF879B4DU55 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF879B4DU55 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms