Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB2A8KAH6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB2A8KAH6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms