Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOBPA7XYQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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