Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTLL13PA6NNM8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTLL13PA6NNM8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms