Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SDR42E2A6NKP2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SDR42E2A6NKP2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms