Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf92A6NGG3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
C9orf92A6NGG3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms