Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L9A6NEM1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms