Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L4A6NEF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms