Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP17L4A6NCW7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms