Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms