Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf170A2RU37 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms