Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC61Q9Y6R9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC61Q9Y6R9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC61Q9Y6R9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC61Q9Y6R9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC61Q9Y6R9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC61Q9Y6R9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC61Q9Y6R9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC61Q9Y6R9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC61Q9Y6R9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC61Q9Y6R9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms