Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPV2Q9Y5S1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPV2Q9Y5S1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPV2Q9Y5S1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRPV2Q9Y5S1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRPV2Q9Y5S1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPV2Q9Y5S1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPV2Q9Y5S1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPV2Q9Y5S1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms