Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHTOPQ9Y3Y2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHTOPQ9Y3Y2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms