Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HCN4Q9Y3Q4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HCN4Q9Y3Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HCN4Q9Y3Q4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HCN4Q9Y3Q4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HCN4Q9Y3Q4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms