Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW0

FOXJ3, Forkhead box protein J3, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ3Q9UPW0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXJ3Q9UPW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXJ3Q9UPW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXJ3Q9UPW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXJ3Q9UPW0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXJ3Q9UPW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXJ3Q9UPW0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms