Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DOLKQ9UPQ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DOLKQ9UPQ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DOLKQ9UPQ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DOLKQ9UPQ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DOLKQ9UPQ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DOLKQ9UPQ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DOLKQ9UPQ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms