Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TTF2Q9UNY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TTF2Q9UNY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TTF2Q9UNY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TTF2Q9UNY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TTF2Q9UNY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TTF2Q9UNY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TTF2Q9UNY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TTF2Q9UNY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TTF2Q9UNY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TTF2Q9UNY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TTF2Q9UNY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms