Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLXNA1Q9UIW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PLXNA1Q9UIW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PLXNA1Q9UIW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PLXNA1Q9UIW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PLXNA1Q9UIW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PLXNA1Q9UIW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PLXNA1Q9UIW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms