Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R1BQ9UD71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PPP1R1BQ9UD71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPP1R1BQ9UD71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R1BQ9UD71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R1BQ9UD71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP1R1BQ9UD71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP1R1BQ9UD71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms