Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F6

ARHGAP20, Rho GTPase-activating protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP20Q9P2F6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP20Q9P2F6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARHGAP20Q9P2F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGAP20Q9P2F6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP20Q9P2F6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ARHGAP20Q9P2F6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGAP20Q9P2F6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP20Q9P2F6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP20Q9P2F6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms