Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms