Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC39A1Q9NY26 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A1Q9NY26 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A1Q9NY26 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A1Q9NY26 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A1Q9NY26 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A1Q9NY26 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A1Q9NY26 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms