Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERVK13-1Q9NX77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK13-1Q9NX77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK13-1Q9NX77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK13-1Q9NX77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms