Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRGBPQ9NV56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRGBPQ9NV56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRGBPQ9NV56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRGBPQ9NV56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRGBPQ9NV56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRGBPQ9NV56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms