Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPOLBQ9NRJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAPOLBQ9NRJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPOLBQ9NRJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLBQ9NRJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms