Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf3Q9JKL4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf3Q9JKL4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf3Q9JKL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufaf3Q9JKL4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf3Q9JKL4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 854.9 ms