Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP8Q9BV40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VAMP8Q9BV40 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP8Q9BV40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms