Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf8Q99PV0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf8Q99PV0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prpf8Q99PV0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prpf8Q99PV0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prpf8Q99PV0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf8Q99PV0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf8Q99PV0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms