Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NBPF4Q96M43 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NBPF4Q96M43 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NBPF4Q96M43 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF4Q96M43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF4Q96M43 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
NBPF4Q96M43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF4Q96M43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF4Q96M43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NBPF4Q96M43 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NBPF4Q96M43 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NBPF4Q96M43 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF4Q96M43 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NBPF4Q96M43 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF4Q96M43 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms