Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD2

Trpv6, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv6Q91WD2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpv6Q91WD2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpv6Q91WD2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpv6Q91WD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpv6Q91WD2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpv6Q91WD2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpv6Q91WD2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpv6Q91WD2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpv6Q91WD2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpv6Q91WD2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv6Q91WD2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv6Q91WD2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms