Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uhrf1Q8VDF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uhrf1Q8VDF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1Q8VDF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1Q8VDF2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uhrf1Q8VDF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Uhrf1Q8VDF2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uhrf1Q8VDF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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