Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TTC21AQ8NDW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TTC21AQ8NDW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TTC21AQ8NDW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TTC21AQ8NDW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TTC21AQ8NDW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
TTC21AQ8NDW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TTC21AQ8NDW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TTC21AQ8NDW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TTC21AQ8NDW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TTC21AQ8NDW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TTC21AQ8NDW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TTC21AQ8NDW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TTC21AQ8NDW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TTC21AQ8NDW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TTC21AQ8NDW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TTC21AQ8NDW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
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