Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHTF2Q8N3S3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHTF2Q8N3S3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHTF2Q8N3S3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHTF2Q8N3S3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHTF2Q8N3S3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms