Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Hecw1Q8K4P8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,62
Hecw1Q8K4P8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Hecw1Q8K4P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,57■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Hecw1Q8K4P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37,48■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Hecw1Q8K4P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Hecw1Q8K4P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Hecw1Q8K4P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
Hecw1Q8K4P8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Hecw1Q8K4P8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Hecw1Q8K4P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Hecw1Q8K4P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Hecw1Q8K4P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37,2■■■■□ 3,55
Hecw1Q8K4P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Hecw1Q8K4P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37,1■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Hecw1Q8K4P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Hecw1Q8K4P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Hecw1Q8K4P8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Hecw1Q8K4P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Hecw1Q8K4P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Hecw1Q8K4P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36,97■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Hecw1Q8K4P8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms