Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ncapd2Q8K2Z4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Ncapd2Q8K2Z4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd2Q8K2Z4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncapd2Q8K2Z4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncapd2Q8K2Z4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ncapd2Q8K2Z4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ncapd2Q8K2Z4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncapd2Q8K2Z4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd2Q8K2Z4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ncapd2Q8K2Z4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ncapd2Q8K2Z4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms